index.php 在CI的解压目录下的，和system文件夹并列

<?php
//定义ENVIRONMENT，system_path，application_folder
//根据system_path，application_folder，定义常量BASEPATH，APPPATH，SELF, EXT， FCPATH，SYSDIR
 *---------------------------------------------------------------
 * APPLICATION ENVIRONMENT
 *---------------------------------------------------------------
 *
 * You can load different configurations depending on your
 * current environment. Setting the environment also influences
 * things like logging and error reporting.
 *
 * This can be set to anything, but default usage is:
 *
 *     development
 *     testing
 *     production
 *
 * NOTE: If you change these, also change the error_reporting() code below
 *
 */
 
 //ENVIRONMENT 决定是否报错
 define('ENVIRONMENT', 'development');
/*
 *---------------------------------------------------------------
 * ERROR REPORTING
 *---------------------------------------------------------------
 *
 * Different environments will require different levels of error reporting.
 * By default development will show errors but testing and live will hide them.
 */
if (defined('ENVIRONMENT'))
{
 switch (ENVIRONMENT)
 {
  case 'development':
   //E_ALL :所有错误都报
   error_reporting(E_ALL);
  break;
  case 'testing':
  case 'production':
   error_reporting(0);
  break;
  default:
   exit('The application environment is not set correctly.');
 }
}
//system文件夹的名字，谁没事儿改它啊
/*
 *---------------------------------------------------------------
 * SYSTEM FOLDER NAME
 *---------------------------------------------------------------
 *
 * This variable must contain the name of your "system" folder.
 * Include the path if the folder is not in the same  directory
 * as this file.
 *
 */
 $system_path = 'system';
 
 //寻找哪个文件夹里的controller
 // 没有后斜杠！！
/*
 *---------------------------------------------------------------
 * APPLICATION FOLDER NAME
 *---------------------------------------------------------------
 *
 * If you want this front controller to use a different "application"
 * folder then the default one you can set its name here. The folder
 * can also be renamed or relocated anywhere on your server.  If
 * you do, use a full server path. For more info please see the user guide:
 * http://codeigniter.com/user_guide/general/managing_apps.html
 *
 * NO TRAILING SLASH!
 *
 */
 $application_folder = 'application/mysjjy';
 
 //system/core/router.php 
/*
 * --------------------------------------------------------------------
 * DEFAULT CONTROLLER
 * --------------------------------------------------------------------
 *
 * Normally you will set your default controller in the routes.php file.
 * You can, however, force a custom routing by hard-coding a
 * specific controller class/function here.  For most applications, you
 * WILL NOT set your routing here, but it's an option for those
 * special instances where you might want to override the standard
 * routing in a specific front controller that shares a common CI installation.
 *
 * IMPORTANT:  If you set the routing here, NO OTHER controller will be
 * callable. In essence, this preference limits your application to ONE
 * specific controller.  Leave the function name blank if you need
 * to call functions dynamically via the URI.
 *
 * Un-comment the $routing array below to use this feature
 *
 */
 // The directory name, relative to the "controllers" folder.  Leave blank
 // if your controller is not in a sub-folder within the "controllers" folder
 // $routing['directory'] = '';
 // The controller class file name.  Example:  Mycontroller
 // $routing['controller'] = '';
 // The controller function you wish to be called.
 // $routing['function'] = '';

/*
 * -------------------------------------------------------------------
 *  CUSTOM CONFIG VALUES
 * -------------------------------------------------------------------
 *
 * The $assign_to_config array below will be passed dynamically to the
 * config class when initialized. This allows you to set custom config
 * items or override any default config values found in the config.php file.
 * This can be handy as it permits you to share one application between
 * multiple front controller files, with each file containing different
 * config values.
 *
 * Un-comment the $assign_to_config array below to use this feature
 *
 */
 // $assign_to_config['name_of_config_item'] = 'value of config item';

// --------------------------------------------------------------------
// END OF USER CONFIGURABLE SETTINGS.  DO NOT EDIT BELOW THIS LINE
// --------------------------------------------------------------------
/*
 * ---------------------------------------------------------------
 *  Resolve the system path for increased reliability
 * ---------------------------------------------------------------
 */
 // Set the current directory correctly for CLI requests
 if (defined('STDIN'))
 {
  chdir(dirname(__FILE__));
 }
 if (realpath($system_path) !== FALSE)
 {
  $system_path = realpath($system_path).'/';
 }
 //确保system的末端带有/
 // ensure there's a trailing slash
 $system_path = rtrim($system_path, '/').'/';
 //如果system path不是一个dir,报错！
 // Is the system path correct?
 if ( ! is_dir($system_path))
 {
  exit("Your system folder path does not appear to be set correctly. Please open the following file and correct this: ".pathinfo(__FILE__, PATHINFO_BASENAME));
 }
/*
 * -------------------------------------------------------------------
 *  Now that we know the path, set the main path constants
 * -------------------------------------------------------------------
 */
  //pathinfo 路径分解
  //SELF index.php
 // The name of THIS file
 define('SELF', pathinfo(__FILE__, PATHINFO_BASENAME));
 //扩展名
 // The PHP file extension
 // this global constant is deprecated.
 define('EXT', '.php');
 //定义BASEPATH 为system_path
 // Path to the system folder
 define('BASEPATH', str_replace("\\", "/", $system_path));
 //将index.php去掉
 // Path to the front controller (this file)
 define('FCPATH', str_replace(SELF, '', __FILE__));
 // Name of the "system folder"
 define('SYSDIR', trim(strrchr(trim(BASEPATH, '/'), '/'), '/'));

 //定义APPPATH 为$application_folder.'/'
 // The path to the "application" folder
 //is_dir($filename) 如果 filename 是一个相对路径，则按照当前工作目录检查其相对路径
 //即index.php所在目录下没有application_folder，就找system下有没有，定义为APPPATH
 if (is_dir($application_folder))
 {
  define('APPPATH', $application_folder.'/');
 }
 else
 {
  if ( ! is_dir(BASEPATH.$application_folder.'/'))
  {
   exit("Your application folder path does not appear to be set correctly. Please open the following file and correct this: ".SELF);
  }
  define('APPPATH', BASEPATH.$application_folder.'/');
 }
/*
 * --------------------------------------------------------------------
 * LOAD THE BOOTSTRAP FILE
 * --------------------------------------------------------------------
 *
 * And away we go...
 *
 */
 //引用system/core/CodeIgniter.php
require_once BASEPATH.'core/CodeIgniter.php';
/* End of file index.php */
/* Location: ./index.php */